叶绿素指标值代表湖水中藻类浓度值，能够反映湖水富营养化水平，即环境污染水平。叶绿素A是反映湖水富营养化的关键指标值。与水体中的总氮、总磷、氨氮、硝酸盐氮、pH、总有机碳有关。假如叶绿素过高，将会造成水华或是赤潮。水体质量会降低。达到一定的指标值就会造成水体富营养化。

水体富营养化的危害：富营养化会危害水体的水质，会导致水的透明度下降，使阳光难以穿透水层，从而影响水中植物的光合作用，可能导致氧气过度饱和。氧气的过度饱和和水中氧气的减少对水生动物有害，导致大量鱼类死亡。同时，由于水体富营养化，大量以蓝藻为优势的藻类在水体表面生长，形成了一层“绿色浮渣”，导致底层积聚的有机物在厌氧条件下分解产生的有害气体和一些浮游生物产生的生物毒素也会因富营养化学物质中含有硝酸盐和亚硝酸盐而受伤。如果人类和动物长时间饮用超过一定标准的水，它们也会中毒。

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